Gerar CT-e pelo XML da NF-e

No menu esquerdo selecione a opção FISCAL > EMITIR CTE

Na tela do Conhecimento de Transporte selecione o MAIS OPÇÕES > NOTA PARA CT-E

Em seguida localize o arquivo XML salvo em seu computador, caso deseje importar mais de uma NFe basta ir selecionando os arquivos XML, quando forem carregados irão aparecer em tela.

O sistema também possibilita no caso de mais de um arquivo XML de NF-e informar se deseja agrupar todas as notas no mesmo CTe, se não deseja agrupar, se deseja agrupar no caso de mesmo Remetente e mesmo Destinatário, só no caso do mesmo Emitente (Globalizado) ou mesmo destinatário (Globalizado).

Em seguida basta clicar em TRANSFORMAR e o CT-e será montado, sendo necessário abrir para concluir o preenchimento de algumas informações.